专项审计调查，是指审计机关为了及时向各级人民政府提供经济信息，促进宏观调控，主要通过审计对与国家财政收支有关或者本级人民政府交办的特定事项，向有关地方、部门、单位进行的专门调查活动。《审计署2003-2007年审计工作发展规划》指出：“实行审计与专项审计调查并重，逐步提高项审计调查的比重，争取到2007年专项审计调查项目占整个项目的一半左右。重点调查国家政策法规执行中存在的问题和重大决策的落实情况，促进加强宏观管理，完善法规制度”，今年全国审计工作会议确定的三项重点之一也是要加大审计调查的覆盖面和力度。这表明审计调查作为审计方式的一种创新，越来越受到重视和加强，而当前审计调查还处于起步阶段，在实践中深感有许多理论尚待探讨，下面就专项审计调查的有关问题谈一些看法。
一、开展专项审计调查的现实意义
(一)专项审计调查能充分发挥审计监督在促进宏观决策方面的作用。当前，我国正处于经济体制转轨、社会转型的特定历史时期，经济工作中存在的许多问题，是涉及改革发展的带有体制性的深层次问题，不能一概以对错评论之，或简单对待这些问题，一般的审计方法有时难以适应，定性处理也不好掌握。而应更多采用专项审计调查的方式，其立足点在于为领导层的决策和政策法规的完善提供依据，对经济生活中存在的大量合理不合法的事项不处理但如实予以反映。最近几年，审计署统一组织的审计项目绝大多数采用了审计调查的方式，并收到了比较好的效果。虽然从微观层面看，审计调查的方式使审计收缴、归还原渠道的资金量大为减少，似乎削弱了审计的力度。然而宏观层面表明，通过审计调查把揭露问题与从体制上、机制上深入分析原因结合起来，更有助于领导的科学决策和政策法规的完善。
（二）专项审计调查可以集中深刻地反映经济生活中的突出问题。应该说，审计与专项审计调查各有侧重点和特点。审计主要是针对各个具体的项目和单位，突出 “摸清家底”，进而揭露问题，促进各单位自身加强管理，具有很强的微观性；而专项审计调查在很多情况下针对的是改革和经济生活中某一方面带有普遍性、苗头性、潜在性的突出问题，也就是通常所说的“重点”、“难点”、“热点”问题，直接为领导的决策提供服务，具有相当的宏观性，可以集中深刻地反映经济生活中的突出问题。
（三）专项审计调查可以更好地提高审计工作的质量和水平。
专项审计调查更有效地扩大审计监督面，缓解任务重、人手少的突出矛盾，为日常审计（包括行政事业审计、经济责任审计、投资审计等）提供基础性信息，减少审前调查，使审计项目计划的制定更具针对性、科学性，更有利于 “全面审计、突出重点”。开展专项审计调查，必须具有全局观念，善于把握总体概念，注重审计成果的加工提炼，通过专项审计调查实践，更有利于提高审计人员的综合水平，培养复合型人才，更好地提高审计工作的质量和水平。另外，随着时代的发展，政府职能由管理向服务的转变，作为政府组成部门的审计，也应该形成与被审计单位互动的良性循环局面。通过审计调查，从体制上、机制上提出有益于被审计单位的建议或者通过审计的呼吁，帮助被审计单位解决实际困难，而不仅仅是处理处罚，这些措施更会受到被审计单位的欢迎，从而形成审计与被审计单位的良性互动。